Se trata de una entidad aconfesional autogestionada en la que su órgano rector, la Junta de Gobierno, está constituida por diez miembros elegidos de entre sus personas Socios Titulares en su Asamblea General por periodos de 2 años.

La Junta de Gobierno se reúne de forma ordinaria todos los meses mientras que la Asamblea General ordinaria convocando a todas las personas Socias Titulares de SAN FELIPE, se celebra una vez al año con un orden del día que presenta y somete a aprobación la memoria de gestión y el balance y cuenta de resultados del ejercicio anterior refrendados por los correspondientes informe de auditoría y descargo del actuario colegiado para finalizar con un presupuesto del ejercicio en curso, establecimiento de importes y cuotas y renovación de cargos de la Junta de Gobierno.